En tant qu'auto-entrepreneur, vous cotisez à l'assurance maladie via vos charges sociales URSSAF. En contrepartie, vous bénéficiez d'indemnités journalières (IJ) en cas d'arrêt maladie. Cependant, les conditions d'accès et les montants sont très différents de ceux des salariés. Ce guide 2025 vous explique tout.

📋 Sommaire

  1. Conditions pour toucher des indemnités
  2. Le délai de carence
  3. Calcul des indemnités journalières
  4. Les démarches à effectuer
  5. Que se passe-t-il pour vos charges URSSAF ?
  6. Arrêt maternité et paternité

1. Conditions pour toucher des indemnités journalières

Pour bénéficier des IJ en tant qu'auto-entrepreneur, vous devez remplir deux conditions cumulatives :

✅ Condition 1

Être affilié à la Sécurité Sociale des Indépendants depuis au moins 12 mois consécutifs

✅ Condition 2

Avoir réalisé un chiffre d'affaires minimum générant des cotisations suffisantes sur les 3 dernières années

Le seuil de CA minimum pour ouvrir des droits aux IJ est d'environ 4 046 € par an (soit le CA générant des cotisations maladie équivalentes à 1/12ème du PASS). Si votre CA est très faible ou nul, vous risquez de ne percevoir aucune indemnité.

⚠️ Première année : Si vous venez de créer votre auto-entreprise, vous n'avez probablement pas encore 12 mois d'affiliation. Vous ne bénéficierez donc pas d'IJ lors de votre première année. C'est l'une des raisons pour lesquelles une mutuelle santé TNS est fortement recommandée dès le début.

2. Le délai de carence

Contrairement aux salariés qui ont 3 jours de carence, les auto-entrepreneurs ont un délai de carence de 3 jours pour les maladies de courte durée, mais ce délai s'allonge selon la durée de l'arrêt :

Durée de l'arrêtDélai de carenceIJ versées à partir du
Arrêt court (< 7 jours)3 jours4ème jour
Arrêt de 7 à 30 jours3 jours4ème jour
Arrêt long (> 30 jours)3 jours4ème jour

Le délai de carence de 3 jours signifie que les 3 premiers jours d'arrêt ne sont jamais indemnisés. Pour un arrêt d'une semaine, vous serez indemnisé seulement 4 jours sur 7.

3. Calcul des indemnités journalières 2025

Le montant de vos IJ est calculé sur la base de votre revenu annuel moyen des 3 dernières années, et non sur votre CA. La formule est la suivante :

IJ = Revenu annuel moyen ÷ 730

Plafonné à 1/730ème de 3 fois le PASS annuel

Exemples concrets

Exemple 1 — CA moyen de 20 000 €/an
Revenu moyen (après abattement forfaitaire ~34% pour services) ≈ 13 200 €/an
IJ = 13 200 ÷ 730 = ~18 €/jour
Pour 30 jours d'arrêt : (30-3) × 18 = 486 € bruts
Exemple 2 — CA moyen de 50 000 €/an
Revenu moyen (après abattement) ≈ 33 000 €/an
IJ = 33 000 ÷ 730 = ~45 €/jour
Pour 30 jours d'arrêt : (30-3) × 45 = 1 215 € bruts

⚠️ Ces montants sont nettement inférieurs à ceux d'un salarié pour le même revenu. C'est pourquoi une prévoyance privée (mutuelle TNS) est indispensable pour compléter.

💡 Calculez votre revenu net réel pour évaluer le niveau de prévoyance nécessaire :

Simuler mon revenu net →

4. Les démarches en cas d'arrêt maladie

  1. Consulter votre médecin → Il vous remet un avis d'arrêt de travail en 3 volets (cerfa n°10170)
  2. Envoyer les volets 1 et 2 à votre CPAM dans les 48h → Par courrier ou via ameli.fr
  3. Volet 3 (information) : Pour les auto-entrepreneurs, il n'y a pas d'employeur à prévenir — vous pouvez le conserver
  4. Respecter les horaires de sortie → Votre médecin peut autoriser des sorties libres ou limitées (8h-10h et 16h-18h)
  5. Déclarer sur ameli.fr → Renseignez votre RIB si ce n'est pas déjà fait pour recevoir les IJ

Délai de versement

Les IJ sont versées en général 2 à 4 semaines après la réception du dossier par la CPAM. En cas de retard, contactez directement votre caisse via ameli.fr.

5. Que se passe-t-il pour vos charges URSSAF pendant l'arrêt ?

Bonne et mauvaise nouvelle en même temps :

  • Si votre CA est nul pendant l'arrêt : vous déclarez 0 € et ne payez aucune cotisation URSSAF pour cette période
  • ⚠️ Si vous continuez à facturer (travail à distance, missions pré-existantes…) : vous déclarez normalement et payez les charges sur ce CA
  • Attention : Travailler pendant un arrêt maladie peut entraîner la suspension des IJ et des sanctions de la CPAM

6. Arrêt maternité et paternité pour auto-entrepreneurs

Congé maternité

Les auto-entrepreneures ont droit à un congé maternité indemnisé de 16 semaines (plus selon le rang de l'enfant). L'allocation forfaitaire de repos maternel est versée en deux fois :

  • 1ère moitié à l'arrêt de toute activité (au moins 8 semaines)
  • 2ème moitié à la reprise d'activité

Le montant 2025 est d'environ 3 864 € à 3 864 € (1/12ème du PASS × 2 pour naissance simple), plus des IJ journalières si vous avez suffisamment cotisé.

Congé paternité

Les pères auto-entrepreneurs ont droit à 28 jours calendaires (+ 3 jours de naissance) de congé paternité, avec des IJ calculées selon les mêmes règles que la maladie.

Préparez votre protection financière

Calculez vos charges et votre revenu net pour évaluer votre niveau de prévoyance idéal.

Mes charges URSSAF Mon revenu net